Астрономия и микроскопия

Форум сайта "Два Стрельца"
Текущее время: 29 мар 2024, 03:00

Часовой пояс: UTC + 3 часа




Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 51 ]  На страницу Пред.  1, 2, 3, 4  След.
Автор Сообщение
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 20 май 2021, 13:40 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Duke писал(а):
Алексей Лк писал(а):
Хотя можете взять в аренду фотоаппарат на день и сравнить. Без этого все просто слова.


Вопрос как быть с адаптером для микроскопа и где его брать остался открытым. Собрать бокс с охлаждением Петелья для фотика за ~ 300000р это что то на грани фантастики и требует нетривиальных инженерных навыков (и кто рискнет пожертвовать фотиком за 300000к ради такого). Один адаптер с этим охлаждением будут стоить как новая цифровая камера для микроскопии, в которой будет и Петелье и все остальное.


Зачем мудрить когда можно просто по статьям глянуть какие сенсоры использовали чаще всего. Я в соседней ветке про «Вопросы по микроскопии» кинул фотку с камеры с сенсором Sony IMX178, по ней все ясно какого уровня должно быть изображение, и оно не сильно отстает от конфокала.

________________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1


Последний раз редактировалось Алексей Лк 20 май 2021, 14:35, всего редактировалось 2 раз(а).

Вернуться к началу
 Профиль  
 

 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 20 май 2021, 13:55 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Duke писал(а):
Алексей Лк писал(а):
С пельтье-то конечно, дело другое.
Сам сенсор все равно в разы хуже, но холод снижает уровень шумов в десятки-сотни раз. Для фотоаппаратов тоже можно собрать бокс с пельтье, тогда она на голову ваши камеры переплюнет.
Хотя можете взять в аренду фотоаппарат на день и сравнить. Без этого все просто слова.


для примера привел две фотки, одна черно-белая снята на сенсор Sony ICX285 (золотой стандарт), вторая цветная на сенсор Sony IMX178, обе фотки сделаны на Olympus BX51 с примерно одинаковым разрешением в пикселях, обе камеры с охлаждением. Претензии по качеству изображения есть?

________________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1


Последний раз редактировалось Алексей Лк 20 май 2021, 14:10, всего редактировалось 3 раз(а).

Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 20 май 2021, 13:56 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Duke писал(а):
Алексей Лк писал(а):
Duke писал(а):
Без этого все просто слова.


вот собственно сами фотки

________________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51


Вложения:
4196BDD6-DEF2-49F7-AF1E-DCC31C3E1C1D.jpeg
4196BDD6-DEF2-49F7-AF1E-DCC31C3E1C1D.jpeg [ 235.87 КБ | Просмотров: 3918 ]
61FD2ADD-0CD8-4078-AE21-8F5D81B9B015.jpeg
61FD2ADD-0CD8-4078-AE21-8F5D81B9B015.jpeg [ 197.37 КБ | Просмотров: 3918 ]

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 20 май 2021, 14:35 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 16 янв 2014, 16:39
Сообщения: 2154
Откуда: г. Санкт-Петербург
Мягко говоря не впечатляет :)


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 20 май 2021, 14:37 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Duke писал(а):
Мягко говоря не впечатляет :)


Ок не вопрос, приведите камеры и фотки которые впечатляют))) только не с конфокала ладно, обычная флуоресценция. И пожалуйста четко обозначьте параметры и модели сенсоров, которые впечатляют. Без этого это просто слова

_______________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 15:47 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Duke писал(а):
Мягко говоря не впечатляет :)


Итак, пока уважаемый Duke (абсолютно без сарказма) ищет (или не ищет) качественные фото, которые должны всех впечатлить, я поделюсь информацией о камерах для SIM-микроскопии, модели взяты мной из разных статей, DOI которых я приведу. Сравнивать имеет смысл с сенсором Sony ICX285 (золотой стандарт).

Все камеры идут с охлаждением, кроме охлаждения для нас важно еще три ключевых параметра - тип сенсора, размер пикселя в матрице и конечное разрешение изображения в пикселях). По всем остальным параметрам нижеперечисленные камеры отличаются не сильно.

Итак, первая камера - SIM camera (Hamamatsu, Orca Flash 4.0), используется в Nikon N-SIM Super-Resolution microscope

doi: 10.1126/sciadv.aaz3870, https://doi.org/10.1016/j.bpj.2021.04.027

1) Тип сенсора - sCMOS
2) Размер пикселя - 6.5x6.5 мкм
3) Разрешение 2048х2048 пикселей

________________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51


Вложения:
0ABFA262-D46B-429D-9256-C8654CEDD6E9.jpeg
0ABFA262-D46B-429D-9256-C8654CEDD6E9.jpeg [ 202.87 КБ | Просмотров: 3825 ]
D2D06DDB-E6D7-4FEA-A25A-235E290110D8.jpeg
D2D06DDB-E6D7-4FEA-A25A-235E290110D8.jpeg [ 201.27 КБ | Просмотров: 3827 ]

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1


Последний раз редактировалось Алексей Лк 21 май 2021, 16:38, всего редактировалось 1 раз.
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 15:57 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Алексей Лк писал(а):
Duke писал(а):

Итак, первая камера


Вторая камера - sCMOS camera (Cooke, pco.edge)

doi:10.1038/nmeth.2025.

1) Тип сенсора - sCMOS
2) Размер пикселя - 6.5x6.5 мкм
3) Разрешение 2560х2160 пикселей

________________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51


Вложения:
2ECC2AEE-97FC-41B4-87B8-7F14B4386DF3.jpeg
2ECC2AEE-97FC-41B4-87B8-7F14B4386DF3.jpeg [ 199.67 КБ | Просмотров: 3822 ]

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1


Последний раз редактировалось Алексей Лк 21 май 2021, 16:39, всего редактировалось 1 раз.
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 16:11 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Алексей Лк писал(а):
Duke писал(а):

Итак, первая камера


Третья камера - back-illuminated Cascade II 512 3 512 EMCCD camera (Photometrics)

DOI: 10.1104/pp.110.157941, doi:10.1017/S1431927611000158

1) Тип сенсора - e2v, CCD97
2) Размер пикселя - 16х16 мкм
3) Разрешение 512х512 пикселей

Сверхвысокая чувствительность сенсора этой камеры слегка нивелируется очень посредственным разрешением полученных изображений

________________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51


Вложения:
1D2D049E-5504-4A74-BBBD-AA697938092E.jpeg
1D2D049E-5504-4A74-BBBD-AA697938092E.jpeg [ 119.35 КБ | Просмотров: 3820 ]

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1


Последний раз редактировалось Алексей Лк 21 май 2021, 18:53, всего редактировалось 2 раз(а).
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 16:14 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Алексей Лк писал(а):
Duke писал(а):

Итак, первая камера


Четвертая камера - 12-bit CCD camera (Cooke, sensicam qe)

DOI: 10.1364/oe.17.014710, doi:10.1016/j.micron.2010.06.016

1) Тип сенсора - CCD
2) Размер пикселя - 6.5x6.5 мкм
3) Разрешение 1376x1040 пикселей

_______________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51


Вложения:
70EAB0DD-5C09-482E-9EFF-3DF64AE9D4DB.jpeg
70EAB0DD-5C09-482E-9EFF-3DF64AE9D4DB.jpeg [ 200.19 КБ | Просмотров: 3819 ]

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1
Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 19:11 
Не в сети

Зарегистрирован: 31 май 2013, 15:16
Сообщения: 2498
Откуда: Мончегорск
зачем изобретать велосипед, может проще взять обычную зеркалку?

но вообще для SIM основной параметр для матрицы будет чувствительность и уровень шума.

все остальное не критично, размер пикселя можно масштабировать, так как он будет оптимальный только для конкретного соотношения увеличения/апертуры, потому скорее всего не можно а нужно будет, ну а размер матрицы в пикселях при его недостатке можно компенсировать панорамированием.

_________________
Мой зоопарк:
Биолам (АУ-12 КОН-3)
МБИ-3 (АУ-12 ОИ-14)
Люмам-И1 (АУ-26 МФН-11 КФ-4)
МБИ-15 (ПК-3, без План-Апо)
Carl Zeiss Amplival
Микмед 2 вар. 2
PZO DIC, МФА, 3D Gamma
and etc


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 19:21 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Mildi писал(а):
зачем изобретать велосипед, может проще взять обычную зеркалку?


Не знаю, я сторонник использования профессиональных камер, тем более их сейчас можно и на алиэаспресс заказать без проблем.

Минусы фотоаппаратов следующие
1) требуется дорогой (обычно) адаптер для микроскопа, который еще надо найти
2) нет вывода (обычно) на экран монитора
3) неизвестно как фотоаппарат снимет флуоресценцию, хватит ли его возможностей
4) цена качественного фотоаппарата сопоставима с ценой профессиональной камеры
5) вес и габариты фотоаппарата скорее всего превосходят те же параметры цифровой камеры.

Для SIM микроскопии как я прочитал критично правильно подогнать камеру, что бы она была стабильна. С фотоаппаратом это полюбом сделать сложнее, он ведь для другого все же предназначен, не для микроскопии.

Я выкладываю здесь параметры камер именно из-за того, что эти камеры уже показали свою пригодность для данного метода, про фотоаппараты я такого сказать не могу. Есть ли статьи где в SIM-микроскоп ставили фотоаппарат? сомневаюсь, а раз так то лучше использовать то, что гарантированно сработает - т.е професиональную цифровую камеру с указанными выше параметрами или близкими к ним.

Подержанные камеры стоят недорого, ищите по типу сенсора а не по бренду, сенсоры все производятся всего парой фирм.

С соотношением сигнал/шум у вышеперечисленных камер все в порядке, поскольку на них и стоит охлаждение. Что же касается размера пикселя - то чем он больше (в микронах), тем лучше камера улавливает слабый сигнал. Если это не сенсор с обратной засветкой (Sony IMX178), то размер 6.5х6.5 мкм считается эталоном.

________________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 21:43 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 25 мар 2017, 12:34
Сообщения: 1816
Откуда: Калининград
Алексей Лк писал(а):
2) нет вывода (обычно) на экран монитора

У всех нормальных фотоаппаратов уже давно есть вывод изображения по HDMI и дистанционное управление через USB. Даже на моём любительском Nikon D5200 почти десятилетней давности всё это уже имеется.

_________________
Оборудование:
Микроскопы Carl Zeiss Jena Nf (ФК Phv с планахроматами, апохроматы), Polmi A (Auflichtkondensor), конденсор Gamma.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 22:11 
Не в сети

Зарегистрирован: 31 май 2013, 15:16
Сообщения: 2498
Откуда: Мончегорск
HDMI не во всех моделях работает в режиме live view, но вот через USB у многих даже старых моделей 10-15 лет давности.
по другим пунктам.
1. обычно не представляет трудности, если имеется стандартный фотовыход а не проприетарный, на алике есть дешевые переходники практически на все стандарты.
3. все нормально, так и снимают и получают довольно интересные фото, качество будет определяться в первую очередь оптикой.
4. Однако фотоаппараты все таки имеют более лучшие параметры в общем, хотя по каким то параметрам и уступают профессиональным камерам(как правило уровень шумов и поддержка специализированным софтом).
5. Это не критично если не пытаться колхозить его на окулярный узел, и не бегать с микроскопом по джунглям.

_________________
Мой зоопарк:
Биолам (АУ-12 КОН-3)
МБИ-3 (АУ-12 ОИ-14)
Люмам-И1 (АУ-26 МФН-11 КФ-4)
МБИ-15 (ПК-3, без План-Апо)
Carl Zeiss Amplival
Микмед 2 вар. 2
PZO DIC, МФА, 3D Gamma
and etc


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 22:32 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 13 апр 2021, 20:58
Сообщения: 972
Откуда: Москва
Mildi писал(а):
HDMI не во всех моделях работает в режиме live view, но вот через USB у многих даже старых моделей 10-15 лет давности.
по другим пунктам.
1. обычно не представляет трудности, если имеется стандартный фотовыход а не проприетарный, на алике есть дешевые переходники практически на все стандарты.
3. все нормально, так и снимают и получают довольно интересные фото, качество будет определяться в первую очередь оптикой.
4. Однако фотоаппараты все таки имеют более лучшие параметры в общем, хотя по каким то параметрам и уступают профессиональным камерам(как правило уровень шумов и поддержка специализированным софтом).
5. Это не критично если не пытаться колхозить его на окулярный узел, и не бегать с микроскопом по джунглям.


1) я не особый специалист по моделям фотоаппаратов, но у меня например есть очень хороший Leica X2 2012 года выпуска. Подсоединить его к микроскопу оказалось невозможно, так как у него несъемный объектив. Выходит что я должен искать другой фотоаппарат. Еще когда то давно у меня была зеркалка Sony за 23000р. Поиск адаптера к ней вывел меня на модель стоимостью в ~ 40000р, так как это нестандартный девайс. Камеру для микроскопа с сенсором Sony ICX262 я очень удачно купил на авито за 8000р.
3) мне как то не попадались такие фото с флуоресценцией, снятые на фотоаппарат, но я специално не искал. Смогу прокомментировать только когда увижу фото.
4) способность уловить слабый сигнал и низкий уровень шума и есть ключевые преимущества профессиональной камеры для флуоресценции и всех производных этого метода. Повторю - если бы фотоаппараты были лучше или как минимум равны цифровым профессиональным камерам, их бы все и использовали, ведь в среднем фотоаппараты дешевле.
5) это не критично, но это вопрос эргономики и удобства. Я на такие вещи очень обращаю внимание.

Любопытно, замечаю некоторое игнорирование аудиторией этого форума современных цифровых камер в пользу фотоаппаратов. Интересно почему, ведь приобрести цифровую профессиональную камеру сейчас не составляет труда, и стоить она будет не сильно дороже какого нибудь крутого фотоаппарата с адаптером для микроскопии, а то и дешевле, и при этом гарантированно будет выдавать приемлемый результат.

________________
Leitz Laborlux S
Olympus BX51

_________________
Leitz Laborlux S
Leitz Dialux
Leitz Labovert (два)
Campden Instruments HA752
Slide PFM medical 2003
Leica SM2000R
3D Gamma
объективы Zeiss Epiplan-Neofluar 5x,10x,20x,50х,100x (резьба М27)
объективы интерференционные МИО-1


Вернуться к началу
 Профиль  
 
 Заголовок сообщения: Re: SIM - микроскопия
СообщениеДобавлено: 21 май 2021, 22:54 
Не в сети
Аватара пользователя

Зарегистрирован: 25 мар 2017, 12:34
Сообщения: 1816
Откуда: Калининград
Алексей Лк писал(а):
Поиск адаптера к ней вывел меня на модель стоимостью в ~ 40000р, так как это нестандартный девайс.

Адаптер никогда не был проблемой. На все системы существует переходник на резьбу М42, а с М42 на ластохвост микроскопа уже легко найти адаптер, в крайнем случае сделать на заказ хоть из чернёной бронзы, обойдётся не дороже пары тысяч.

_________________
Оборудование:
Микроскопы Carl Zeiss Jena Nf (ФК Phv с планахроматами, апохроматы), Polmi A (Auflichtkondensor), конденсор Gamma.


Вернуться к началу
 Профиль  
 
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ Сообщений: 51 ]  На страницу Пред.  1, 2, 3, 4  След.

Часовой пояс: UTC + 3 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Majestic-12 [Bot], ИНО и гости: 78


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Перейти:  
Создано на основе phpBB® Forum Software © phpBB Group
Русская поддержка phpBB
Яндекс.Метрика